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Antiretroviral-naive and -treated HIV-1 patients can harbour more resistant viruses in CSF than in plasma
Cathia Soulié 1 Diane Descamps 2 Vé Ronique Schneider Mary-Anne Trabaud Laurence Morand-Joubert 3 Constance Delaugerre 4 Brigitte Montes 5 Francis Barin 6 Virginie Ferré 7 Anne Maillard 8 Sophie Vallet 9 Catherine Roussel 10 Lambert Assoumou 1 Vincent Calvez 11 Philippe Flandre 1 Anne-Geneviè Ve H. Jeulin 12 A. Guigon E. Lagier H. Le Guillou C. Alloui D. Bettinger 13 C. Pallier 14 H. Fleury S. Reigadas 15 P. Bellecave 15 P. Recordon-Pinson C. Payan 16 A. Vabret 17 C. Henquell 18 A. Mirand 19 M. Bouvier-Alias 20 Alexis de Rougemont 21, 22, 23, 24 G. dos Santos P. Morand 25 A. Signori-Schmuck 26 L. Bocket S. Rogez 27 P. Andre 28 J. Tardy 29 C. Tamalet 30 C. Delamare E. Schvoerer 12 E. André-Garnier 31 J. Cottalorda 32 J. Guinard A. Guiguon F. Brun-Vezinet C. Charpentier B. Visseaux G. Peytavin 33 A. Krivine 34 A. Si-Mohamed V. Avettand-Fenoel 35 A.-G. Marcelin 36 S. Lambert-Niclot 36 M. Wirden 36 M. Chaix C. Amiel 37 V. Schneider 38 G. Giraudeau V. Brodard J. Plantier C. Chaplain T. Bourlet 25 S. Fafi-Kremer 39 F. Stoll-Keller 40 M. Schmitt H. Barth 41 S. Yerly C. Poggi 42 Jacques Izopet 43 S. Raymond 44 A. Chaillon S. Marque-Juillet A. Roque-Afonso S. Haim-Boukobza Maxime Grude 36 D. Costagliola T. Allegre 45 J. Schmit J. Chennebault O. Bouchaud N. Magy-Bertrand 13 J. Delfraissy M. Dupon 46 P. Morlat D. Neau 47 S. Ansart 48 S. Jaffuel 49 R. Verdon 50 C. Jacomet Y. Levy S. Dominguez P. Chavanet 51 L. Piroth 52 A. Cabié 53 P. Leclercq F. Ajana A. Cheret P. Weinbreck L. Cotte 54 I. Poizot-Martin 55 I. Ravaud B. Christian F. Truchetet M. Grandidier J. Reynes 56 T. May 57 F. Goehringer 58 F. Raffi 59 P. Dellamonica 25 T. Prazuck 36 L. Hocqueloux P. Yeni R. Landman O. Launay 60 L. Weiss J. Viard C. Katlama 61 A. Simon Pascal Girard 62 J. Meynard J. Molina 63 G. Pialoux B. Hoen 64 M. Goeger-Sow I. Lamaury G. Beaucaire R. Jaussaud 65 C. Rouger C. Michelet F. Borsa-Lebas F. Caron 66 M. Khuong F. Lucht 67 D. Rey 68 A. Calmy 69 B. Marchou G. Gras A. Greder-Belan D. Vittecoq 70 E. Teicher 71
11
MMCS - Modélisation mathématique, calcul scientifique
ICJ - Institut Camille Jordan [Villeurbanne]
27
CHU Limoges
41
Environment and Sustainable Development Programme
European Commission - DG Research and Innovation
44
MDN - Magnétisme et Diffusion Neutronique
MEM - Modélisation et Exploration des Matériaux : DRF/IRIG/MEM
51
CHU Dijon
Cathia Soulié 1
Auteur
IdHAL : cathia-soulieORCID : 0000-0001-6949-3630IdRef : 199574979
Diane Descamps 2
Auteur
Vé Ronique Schneider
Auteur
Mary-Anne Trabaud
Auteur
ORCID : 0000-0001-8614-1071
Laurence Morand-Joubert 3
Auteur
Constance Delaugerre 4
Auteur
Brigitte Montes 5
Auteur
ORCID : 0000-0003-2866-4274
Francis Barin 6
Auteur
Lambert Assoumou 1
Auteur
Vincent Calvez 11
Auteur
Philippe Flandre 1
Auteur
ORCID : 0000-0002-2612-3522
Anne-Geneviè Ve
Auteur
H. Jeulin 12
Auteur
IdHAL : helene-jeulinIdRef : 124866883
A. Guigon
Auteur
E. Lagier
Auteur
H. Le Guillou
Auteur
Alexis de Rougemont 21, 22, 23, 24
Auteur
G. dos Santos
Auteur
P. Morand 25
Auteur
A. Signori-Schmuck 26
Auteur
C. Tamalet 30
Auteur
C. Delamare
Auteur
E. Schvoerer 12
Auteur
IdHAL : evelyne-schvoererORCID : 0000-0003-0290-4532IdRef : 083596917
E. André-Garnier 31
Auteur
H. Barth 41
Auteur
S. Yerly
Auteur
C. Poggi 42
Auteur
Jacques Izopet 43
Auteur
Etablissement employeur: Université Toulouse III - Paul SabatierORCID : 0000-0002-8462-3234IdRef : 058353887
S. Raymond 44
Auteur
IdHAL : stephane-raymond
A. Chaillon
Auteur
S. Marque-Juillet
Auteur
A. Roque-Afonso
Auteur
A. Simon
Auteur
ORCID : 0000-0003-4641-6186IdRef : 177556099
Pascal Girard 62
Auteur
J. Meynard
Auteur
J. Molina 63
Auteur
1
Epidémiologie, stratégies thérapeutiques et virologie cliniques dans l'infection à VIH (France)
- UPMC - Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (4 place Jussieu - 75005 Paris - France)
- INSERM - Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale : U943 (101, rue de Tolbiac, 75013 Paris - France)
2
Laboratoire de Virologie (France)
- AP-HP - Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (France)
- AP-HP - Hôpital Bichat - Claude Bernard [Paris] (46 Rue Henri Huchard, 75018 Paris - France)
3
Service de bactériologie-virologie (France)
- AP-HP - Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (France)
- CHU Saint-Antoine [AP-HP] (184, rue du Faubourg Saint-Antoine
75571 Paris cedex 12 - France)
- AP-HP - Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (France)
- SU - Sorbonne Université (21 rue de l’École de médecine - 75006 Paris - France)
4
Génétique et Ecologie des Virus, Génétique des Virus et Pathogénèse des Maladies Virales (Université Paris Diderot, Institut Universitaire d'Hématologie (IUH), Hôpital Saint Louis 1 avenue Claude Vellefaux 75010 Paris - France)
- UPD7 - Université Paris Diderot - Paris 7 (5 rue Thomas-Mann - 75205 Paris cedex 13 - France)
- INSERM - Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale : U941 (101, rue de Tolbiac, 75013 Paris - France)
5
CHRU Montpellier - Centre Hospitalier Régional Universitaire [Montpellier] (191 avenue du doyen Gaston Giraud 34295 Montpellier - France)
6
Centre national de référence du VIH INSERM U966 (France)
- UT - Université de Tours (60 rue du Plat d'Étain, 37020 Tours cedex 1 - France)
7
CHU Nantes - Centre hospitalier universitaire de Nantes (1 Place Alexis-Ricordeau, 44000 Nantes - France)
8
CHU Pontchaillou [Rennes] (2 Rue Henri le Guilloux, 35000 Rennes - France)
9
Laboratoire de Parasitologie et Mycologiede [CHRU Brest] (Hôpital de la Cavale Blanche, Centre Hospitalier Régional Universitaire de Brest, Boulevard Tanguy Prigent, 29609 Brest Cedex, France - France)
10
Service de bactériologie-virologie [Tours] (2, boulevard tonnellé 37000 Tours - France)
- CHRU Tours - Centre Hospitalier Régional Universitaire de Tours (Centre Hospitalier Régional Universitaire de Tours2 Boulevard Tonnellé 37044 Tours cedex 9 - France)
- Hôpital Bretonneau (France)
11
MMCS - Modélisation mathématique, calcul scientifique (Institut Camille Jordan
Villeurbane - France)
- ICJ - Institut Camille Jordan [Villeurbanne] (Bât. Jean Braconnier 43 bd du 11 novembre 1918 69622 VILLEURBANNE CEDEX - France)
- ECL - École Centrale de Lyon (36 avenue Guy de Collongue - 69134 Ecully cedex - France)
- Université de Lyon (92 rue Pasteur - CS 30122, 69361 Lyon Cedex 07 - France)
- UCBL - Université Claude Bernard Lyon 1 (43, boulevard du 11 novembre 1918, 69622 Villeurbanne cedex - France)
- Université de Lyon (92 rue Pasteur - CS 30122, 69361 Lyon Cedex 07 - France)
- INSA Lyon - Institut National des Sciences Appliquées de Lyon (20 Avenue Albert Einstein,
69621 Villeurbanne cedex - France)
- Université de Lyon (92 rue Pasteur - CS 30122, 69361 Lyon Cedex 07 - France)
- INSA - Institut National des Sciences Appliquées (France)
- UJM - Université Jean Monnet [Saint-Étienne] (10 rue Tréfilerie - 42100 Saint-Étienne - France)
- CNRS - Centre National de la Recherche Scientifique : UMR5208 (France)
- ECL - École Centrale de Lyon (36 avenue Guy de Collongue - 69134 Ecully cedex - France)
12
Service de Virologie [CHRU Nancy] (France)
- CHRU Nancy - Centre Hospitalier Régional Universitaire de Nancy (Siège social : 29 avenue du Maréchal de Lattre de Tassigny, CO 60034, 54035 NANCY CEDEX Hôpital Central : 29 Avenue du Maréchal de Lattre de Tassigny, 54035 Nancy Hôpitaux de Brabois / Enfants : Rue du Morvan, 54500 Vandœuvre-lès-Nancy Maternité régionale :10 Avenue Dr Heydenreich, 54000 Nancy - France)
13
CHRU Besançon - Centre Hospitalier Régional Universitaire de Besançon (3, boulevard A. Fleming - 25030 Besançon Cedex - France)
14
LCogn - Neuroimagerie cognitive (CEA 4, Place du General Leclerc 91401 ORSAY CEDEX - France)
- UP11 - Université Paris-Sud - Paris 11 (Bâtiment 300 - 91405 Orsay cedex - France)
- CEA - Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives : DSV/I2BM/NEUROSPIN (Centre de Saclay Centre de Grenoble Centre de Cadarache etc - France)
- INSERM - Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale : U562 (101, rue de Tolbiac, 75013 Paris - France)
15
MFP - Microbiologie Fondamentale et Pathogénicité (Bât. 3A - 1er etg 146 Rue Léo Saignat - 103 33076 BORDEAUX CEDEX - France)
- Université Bordeaux Segalen - Bordeaux 2 (146 rue Léo Saignat - 33076 Bordeaux cedex - France)
- CNRS - Centre National de la Recherche Scientifique : UMR5234 (France)
16
UGA [2016-2019] - Université Grenoble Alpes [2016-2019] (38058 Grenoble cedex - France)
17
Laboratoire de Virologie Humaine et Moléculaire [Caen] (Centre Hospitalier Universitaire - Avenue de la Côte de Nacre CS 30001 14033 CAEN cedex 9 - France)
- CHU Caen (Avenue de la Côte de Nacre 14000 Caen - France)
- NU - Normandie Université (Esplanade de la Paix - CS 14032 - 14032 Caen Cedex 5 - France)
- TCBN - Tumorothèque de Caen Basse-Normandie (3 avenue du Général Harris 14076 Caen cedex 5 - France)
19
CHU Clermont-Ferrand (France)
20
IMRB - Institut Mondor de Recherche Biomédicale (8 rue du Général Sarrail 94010 Créteil - France)
- INSERM - Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale : U955 (101, rue de Tolbiac, 75013 Paris - France)
- IFR10 (France)
- UPEC UP12 - Université Paris-Est Créteil Val-de-Marne - Paris 12 : UMR955 (61 avenue du Général de Gaulle - 94010 Créteil cedex - France)
21
UFR des Sciences de Santé (Université de Bourgogne) (Université de Bourgogne - 21000 Dijon - France)
- UB - Université de Bourgogne (Maison de l'université - Esplanade Érasme - BP 27877 - 21078 Dijon cedex - France)
22
CNR virus entériques - Centre National de Référence des virus entériques [CHU de Dijon] (Plateau Technique de Biologie - 2 rue Angélique Ducoudray - BP 37013 21070 Dijon cedex - France)
- CHU Dijon - Centre Hospitalier Universitaire de Dijon - Hôpital François Mitterrand (CHU Dijon - 14 rue Paul Gaffarel - 21079 Dijon - France)
23
Laboratoire de sérologie-virologie (CHU de Dijon) (CHU de Dijon - 14 rue Paul Gaffarel - 21079 Dijon - France)
- CHU Dijon - Centre Hospitalier Universitaire de Dijon - Hôpital François Mitterrand (CHU Dijon - 14 rue Paul Gaffarel - 21079 Dijon - France)
24
PAM - Procédés Alimentaires et Microbiologiques [Dijon] (Université Bourgogne Franche-Comté - AgroSup Dijon - Batiment Epicure - 1 esplanade Erasme - F-21000 Dijon - France)
- UB - Université de Bourgogne (Maison de l'université - Esplanade Érasme - BP 27877 - 21078 Dijon cedex - France)
- AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement : UMR-MA 2012.02.102 (26 Boulevard du Dr Petitjean - BP 87999 - 21079 Dijon cedex - France)
- UBFC - Université Bourgogne Franche-Comté [COMUE] (France)
25
IBCP - Institut de biologie et chimie des protéines [Lyon] (7 Passage du Vercors 69367 LYON CEDEX 07 - France)
- UCBL - Université Claude Bernard Lyon 1 (43, boulevard du 11 novembre 1918, 69622 Villeurbanne cedex - France)
- Université de Lyon (92 rue Pasteur - CS 30122, 69361 Lyon Cedex 07 - France)
- CNRS - Centre National de la Recherche Scientifique : UMS3760 / FR3302 (France)
26
UVHCI - Biologie structurale des interactions entre virus et cellule hôte (6 rue Jules Horowitz, BP 181
38042 GRENOBLE CEDEX 9 - France)
- UJF - Université Joseph Fourier - Grenoble 1 (BP 53 - 38041 Grenoble Cedex 9 - France)
- EMBL - European Molecular Biology Laboratory [Grenoble] (71 avenue des Martyrs CS 90181 38042 Grenoble Cedex 9 - France)
- CNRS - Centre National de la Recherche Scientifique : UMI3265 (France)
27
CHU Limoges (Centre Hospitalier Universitaire Dupuytren - 2 avenue Martin Luther King 87042 LIMOGES - France)
28
LINA - Laboratoire d'Informatique de Nantes Atlantique (LINA - Faculté des Sciences 2 rue de la Houssinière - BP 92208 44322 NANTES CEDEX 3 - France)
- Mines Nantes - Mines Nantes (La Chantrerie - 4, rue Alfred Kastler - BP 20722 - 44307 Nantes cedex 3 - France)
- UN - Université de Nantes (1, quai de Tourville - BP 13522 - 44035 Nantes cedex 1 - France)
- CNRS - Centre National de la Recherche Scientifique : UMR6241 (France)
29
LEOM - Laboratoire d'électronique, optoélectronique et microsystèmes (bat. 7 36 Av Guy de Collongue - BP 163 69131 ECULLY CEDEX - France)
- ECL - École Centrale de Lyon (36 avenue Guy de Collongue - 69134 Ecully cedex - France)
- Université de Lyon (92 rue Pasteur - CS 30122, 69361 Lyon Cedex 07 - France)
- CNRS - Centre National de la Recherche Scientifique : UMR5512 (France)
30
URMITE - Unité de Recherche sur les Maladies Infectieuses et Tropicales Emergentes (27 Bd Jean Moulin 13385 MARSEILLE Cedex 5 - France)
- IRD - Institut de Recherche pour le Développement : UMR_D198 (Siège Le Sextant 44, bd de Dunkerque CS 90009 13572 Marseille cedex 02 - France)
- AMU - Aix Marseille Université : UM63 (Aix-Marseille Université Jardins du Pharo 58 Boulevard Charles Livon 13284 Marseille cedex 7 - France)
- INSERM - Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale : U1095 (101, rue de Tolbiac, 75013 Paris - France)
- IFR48 (France)
- CNRS - Centre National de la Recherche Scientifique : UMR7278 (France)
31
Hôtel-Dieu de Nantes (France)
32
Service de chirurgie pédiatrique [Hôpital Lapeyronie-Arnaud de Villeneuve] ( Montpellier - France)
- CHU - Hôpital Lapeyronie [Montpellier] (371, avenue du Doyen Gaston Giraud 34295 MONTPELLIER cedex 5 - France)
33
IAME (UMR_S_1137 / U1137) - Infection, Anti-microbiens, Modélisation, Evolution (Faculté de médecine Paris Diderot Paris 7 - site Bichat - 16 rue Henri Huchard 75890 Paris Cedex 18 - France)
- UP13 - Université Paris 13 (France)
- UPD7 - Université Paris Diderot - Paris 7 : UMR_S_1137 (5 rue Thomas-Mann - 75205 Paris cedex 13 - France)
- USPC - Université Sorbonne Paris Cité (Université Sorbonne Paris Cité | 100-104, avenue de France | 75013 Paris - France)
- INSERM - Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale : U1137 (101, rue de Tolbiac, 75013 Paris - France)
34
AP-HP - Hôpital Cochin Broca Hôtel Dieu [Paris] (Bâtiment Port-Royal - 53 Avenue de l'Observatoire 75014 Paris - France)
36
iPLESP - Institut Pierre Louis d'Epidémiologie et de Santé Publique (56, boulevard Vincent Auriol - CS 81393 - 75646 Paris Cedex 13 - France)
- UPMC - Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (4 place Jussieu - 75005 Paris - France)
- INSERM - Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale : U1136 (101, rue de Tolbiac, 75013 Paris - France)
37
ERPCB - Equipe de Recherche en Physico-Chimie et Biotechnologie (Campus 2 - Boulevard du Maréchal Juin 14032 CAEN cedex - France)
- UNICAEN - Université de Caen Normandie : EA 3914 (Esplanade de la Paix - CS 14032 - 14032 CAEN Cedex 5 - France)
- NU - Normandie Université (Esplanade de la Paix - CS 14032 - 14032 Caen Cedex 5 - France)
38
IDES - Interactions et dynamique des environnements de surface (Dépt. des sciences de la terre Bâtiments 504 & 509 91405 ORSAY CEDEX - France)
- UP11 - Université Paris-Sud - Paris 11 (Bâtiment 300 - 91405 Orsay cedex - France)
- INSU - CNRS - Institut national des sciences de l'Univers (INSU-CNRS 3 rue Michel-Ange, 75794 Paris Cedex 16 - France)
- CNRS - Centre National de la Recherche Scientifique : UMR8148 (France)
39
Laboratoire de Virologie [Strasbourg] (Faculté de Mdecine, INSERM-UMR-778, Université de Strasbourg - France)
40
Interaction virus-hôte et maladies du foie (Faculte de Medecine 3 Rue Koeberle 67000 STRASBOURG - France)
- UNISTRA - Université de Strasbourg (4 rue Blaise Pascal - CS 90032 - 67081 Strasbourg cedex - France)
- INSERM - Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale : U748 (101, rue de Tolbiac, 75013 Paris - France)
41
Environment and Sustainable Development Programme (Belgique)
- European Commission - DG Research and Innovation (1049 Brussels Belgium - Belgique)
43
Laboratoire de Virologie [Toulouse] (330 avenue de Grande Bretagne 31059 Toulouse Cedex 9 - France)
- CHU Toulouse [Toulouse] (Hôtel-Dieu Saint Jacques 2, rue Viguerie TSA 80035 31059 Toulouse cedex 9 - France)
44
MDN - Magnétisme et Diffusion Neutronique (CEA
17, rue des Martyrs
F-38054 Grenoble Cedex 9 - France)
- MEM - Modélisation et Exploration des Matériaux : DRF/IRIG/MEM (CEA
17 rue des Martyrs
F-38054 Grenoble Cedex 9 - France)
- UGA [2016-2019] - Université Grenoble Alpes [2016-2019] (38058 Grenoble cedex - France)
- IRIG - Institut de Recherche Interdisciplinaire de Grenoble : DRF/IRIG/DEPHY (France)
- DRF (CEA) - Direction de Recherche Fondamentale (CEA) : DRF/IRIG (Direction de Recherche Fondamentale
Fundamental Research Division
CEA Saclay
91191 Gif-sur-Yvette
- France)
- CEA - Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (Centre de Saclay Centre de Grenoble Centre de Cadarache etc - France)
- DRF (CEA) - Direction de Recherche Fondamentale (CEA) : DRF/IRIG (Direction de Recherche Fondamentale
Fundamental Research Division
CEA Saclay
91191 Gif-sur-Yvette
- France)
45
Centre Hospitalier du Pays d'Aix (France)
46
CHU Bordeaux [Bordeaux] (place Amélie Raba Léon
33076 BORDEAUX CEDEX - France)
47
Fédération des Maladies Infectieuses [Bordeaux] (France)
- CHU de Bordeaux Pellegrin [Bordeaux] (Place Amélie Raba-Léon, 33000 Bordeaux - France)
48
Service de médecine interne 2 et maladies infectieuses (Hôpital de la Cavale-Blanche, CHU de Brest, boulevard Tanguy-Prigent, 29609 Brest cedex, France - France)
50
Unité de Maladies Infectieuses et Tropicales [CHU Caen] (Centre Hospitalier Universitaire
Avenue de la Côte de Nacre
CS 30001
14033 CAEN cedex 9 - France)
- UNICAEN - Université de Caen Normandie (Esplanade de la Paix - CS 14032 - 14032 CAEN Cedex 5 - France)
- NU - Normandie Université (Esplanade de la Paix - CS 14032 - 14032 Caen Cedex 5 - France)
- CHU Caen (Avenue de la Côte de Nacre 14000 Caen - France)
- NU - Normandie Université (Esplanade de la Paix - CS 14032 - 14032 Caen Cedex 5 - France)
- TCBN - Tumorothèque de Caen Basse-Normandie (3 avenue du Général Harris 14076 Caen cedex 5 - France)
51
CHU Dijon (BP1542, 21034 Dijon cedex - France)
- CHU Dijon - Centre Hospitalier Universitaire de Dijon - Hôpital François Mitterrand (CHU Dijon - 14 rue Paul Gaffarel - 21079 Dijon - France)
52
Département d'infectiologie (CHU de Dijon) (CHU Dijon - 14 rue Paul Gaffarel - 21079 Dijon - France)
- CHU Dijon - Centre Hospitalier Universitaire de Dijon - Hôpital François Mitterrand (CHU Dijon - 14 rue Paul Gaffarel - 21079 Dijon - France)
53
CIC - Antilles Guyane - Centre d'Investigation Clinique Antilles-Guyane (Unité de Maladies infectieuses, génétiques, et émergentes - Av des flamboyants 97306 Cayenne - France)
- UAG - Université des Antilles et de la Guyane : EA3593 (Fouillole - BP 250 - 97157 Pointe-à-Pitre - Guadeloupe)
- INSERM - Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale : CIC1424 (101, rue de Tolbiac, 75013 Paris - France)
- CHU Pointe-à-Pitre/Abymes [Guadeloupe] (Route de Chauvel - BP 465 - 97159 Pointe-à-Pitre cedex - France)
- CHU de Fort de France (France)
- Centre Hospitalier Andrée Rosemon [Cayenne, Guyane Française] (Av des flamboyants, Cayenne 97306 - Guyane française)
54
CHLS - Centre Hospitalier Lyon Sud [CHU - HCL] (165 Chemin du Grand Revoyet
69495 Pierre-Bénite - France)
- HCL - Hospices Civils de Lyon (3 Quai des Célestins 69002 Lyon - France)
55
Hôpitaux Sud - Hôpital Sainte-Marguerite [CHU - APHM] (270, boulevard de Sainte-Marguerite
13274 Marseille cedex 9 - France)
56
Hôpital Arnaud de Villeneuve [CHRU Montpellier] (371 avenue du Doyen Gaston Giraud - 34295 Montpellier - France)
- CHRU Montpellier - Centre Hospitalier Régional Universitaire [Montpellier] (191 avenue du doyen Gaston Giraud 34295 Montpellier - France)
58
Service des Maladies Infectieuses et Tropicales [CHRU Nancy] (Vandœuvre-lès-Nancy - France)
- CHRU Nancy - Centre Hospitalier Régional Universitaire de Nancy (Siège social : 29 avenue du Maréchal de Lattre de Tassigny, CO 60034, 54035 NANCY CEDEX Hôpital Central : 29 Avenue du Maréchal de Lattre de Tassigny, 54035 Nancy Hôpitaux de Brabois / Enfants : Rue du Morvan, 54500 Vandœuvre-lès-Nancy Maternité régionale :10 Avenue Dr Heydenreich, 54000 Nancy - France)
59
Service des maladies infectieuses et tropicales [CHU Nantes] (CHU Hôtel-Dieu, 1, place Alexis-Ricordeau, 44093 Nantes cedex 1, France - France)
- CHU Nantes - Centre hospitalier universitaire de Nantes (1 Place Alexis-Ricordeau, 44000 Nantes - France)
60
CIC - Biotherapie - AP-HP (cochin - Pasteur) (Hopital Cochin PARIS V 27, Rue du Faubourg Saint-Jacques 75679 PARIS CEDEX 14 - France)
- INSERM - Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale : CBT505 (101, rue de Tolbiac, 75013 Paris - France)
61
Service de Maladies Infectieuses et Tropicales [CHU Pitié-Salpêtrière] (47-83 boulevard de l'Hôpital
75013 Paris - France)
- CHU Pitié-Salpêtrière [AP-HP] (47-83 Boulevard de l'Hôpital, 75013 Paris - France)
- AP-HP - Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (France)
- SU - Sorbonne Université (21 rue de l’École de médecine - 75006 Paris - France)
62
IES - Institut d’Electronique et des Systèmes (860, rue Saint Priest, Bâtiment 5 - CC 05001 -34095 Montpellier Cedex 5 - France)
- UM - Université de Montpellier (163 rue Auguste Broussonnet - 34090 Montpellier - France)
- CNRS - Centre National de la Recherche Scientifique : UMR5214 (France)
63
LGC - Laboratoire de Génétique Cellulaire (23 Chemin des Capelles BP 87614 31076 Toulouse Cedex 3 - France)
- INRA - Institut National de la Recherche Agronomique : UR 0444 (France)
- ENVT - Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse (23 chemin des Capelles
31076 Toulouse
Cedex - France)
- Toulouse INP - Institut National Polytechnique (Toulouse) (France)
- Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées (41 Allée Jules Guesde, 31000 Toulouse - France)
- Toulouse INP - Institut National Polytechnique (Toulouse) (France)
64
LCE - Laboratoire Chrono-environnement - CNRS - UBFC (UMR 6249) (16, route de Gray - 25030 Besançon Cedex - France)
- CNRS - Centre National de la Recherche Scientifique : UMR 6249 (France)
- UFC - Université de Franche-Comté (1 rue Goudimel 25030 Besançon cedex - France)
65
Service de Médecine interne, Maladies Infectieuses et Immunologie Clinique [Reims] (45 rue Cognacq-Jay 51092 Reims Cedex - France)
- CHU Reims - Centre Hospitalier Universitaire de Reims (45, rue Cognacq-Jay 51100 Reims - France)
66
IEMN - Institut d’Électronique, de Microélectronique et de Nanotechnologie - UMR 8520 ([Univ. Lille, CNRS, Ecole Centrale Lille, Yncréa-ISEN, UVHC] ––
Laboratoire Central – Cité Scientifique – Avenue Poincaré – CS 60069 – 59652 VILLENEUVE D’ASCQ CEDEX - France)
- Centrale Lille (École Centrale de Lille - Cité Scientifique - CS 20048 59651 Villeneuve d'Ascq Cedex - France)
- Institut supérieur de l'électronique et du numérique (ISEN) (France)
- UVHC - Université de Valenciennes et du Hainaut-Cambrésis (Campus Mont Houy 59313 Valenciennes Cedex 9 - France)
- Université de Lille (EPE Université de Lille. -- 42 rue Paul Duez, 59000 Lille - France)
- CNRS - Centre National de la Recherche Scientifique : UMR8520 (France)
- UPHF - Université Polytechnique Hauts-de-France (Campus Mont Houy 59313 Valenciennes Cedex 9 - France)
67
CHU Saint-Etienne (France)
68
CHU Strasbourg (France)
69
HUG - Geneva University Hospital (Suisse)
70
Service de Maladies Infectieuses et Tropicales [CHU Bicêtre] (78, rue du Général Leclerc 94275 Le Kremlin-Bicêtre - France)
- AP-HP Hôpital Bicêtre (Le Kremlin-Bicêtre) (78 Rue du Général Leclerc 94270 Le Kremlin-Bicêtre - France)
71
Hôpital Bicêtre (78, rue du Général Leclerc 94275 Le Kremlin-Bicêtre - France)
- UP11 - Université Paris-Sud - Paris 11 (Bâtiment 300 - 91405 Orsay cedex - France)
- AP-HP - Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (France)
- Hôpital Bicêtre (France)
Abstract : Objectives: The neurological disorders in HIV-1-infected patients remain prevalent. The HIV-1 resistance in plasma and CSF was compared in patients with neurological disorders in a multicentre study. Methods: Blood and CSF samples were collected at time of neurological disorders for 244 patients. The viral loads were .50 copies/mL in both compartments and bulk genotypic tests were realized. Results: On 244 patients, 89 and 155 were antiretroviral (ARV) naive and ARV treated, respectively. In ARV-naive patients, detection of mutations in CSF and not in plasma were reported for the reverse transcriptase (RT) gene in 2/89 patients (2.2%) and for the protease gene in 1/89 patients (1.1%). In ARV-treated patients, 19/152 (12.5%) patients had HIV-1 mutations only in the CSF for the RT gene and 30/151 (19.8%) for the protease gene. Two mutations appeared statistically more prevalent in the CSF than in plasma: M41L (P ¼ 0.0455) and T215Y (P ¼0.0455). Conclusions: In most cases, resistance mutations were present and similar in both studied compartments. However, in 3.4% of ARV-naive and 8.8% of ARV-treated patients, the virus was more resistant in CSF than in plasma. These results support the need for genotypic resistance testing when lumbar puncture is performed.
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Citation
Cathia Soulié, Diane Descamps, Vé Ronique Schneider, Mary-Anne Trabaud, Laurence Morand-Joubert, et al.. Antiretroviral-naive and -treated HIV-1 patients can harbour more resistant viruses in CSF than in plasma. Journal of Antimicrobial Chemotherapy, 2015, 70 (2), pp.566-572. ⟨10.1093/jac/dku419⟩. ⟨hal-02291062⟩
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